دانلود ترجمه مقاله ارزیابی تنوع ژنتیکی در چاودار بر اساس مارکرهای SSR

1. مقدمه 2. مواد و روش ها 3. نتایج 4. بحث و بررسی 5. نتیجه گیری

چکیده – هدف اصلی این مقاله برآورد تنوع ژنتیکی در میان گونه های چاودار با استفاده از 22 مارکر توالی های تکراری ساده (SSR) قبلا منتشر شده می باشد. مواد گیاهی شامل 367 گونه چاودار متشکل از ارقام تاریخی و معاصر، مواد کشت شده، ارقام بومی و گونه های بهنژادی از شرکت بهنژادی لهستانی دانکو می باشد. گونه های مطالعه شده تنوع جغرافیایی گسترده ای را نشان دادند. چندین روش به منظور آنالیز تنوع ژنتیکی در میان گونه های چاودار و به منظور تعیین ساختار جمعیت به کار گرفته شد که شامل آنالیز مولفه اصلی (PCoA)، اتصال - مجاور (NJ) و خوشه بندی بیزین می باشد. همچنین، ما مجموعه اصلی 25 گونه چاودار نماینده ی بیش از 93 درصد آلل های توالی تکراری ساده را نیز تعریف کردیم. نتایج این آنالیز نشان داد که گونه های چاودار در بانک ژن در مقایسه با موادی که به طور مستقیم از شرکت های بهنژادی اروپایی دریافت شده بودند، تفاوت واضحی داشتند. یافته های ما پیشنهاد می دهد که منبع ژنتیکی ارقام فعلی چاودار در طول فرایندهای بهنژادی محدودتر شده است. مجموعه ی منتخبی از مارکرهای توالی تکراری ساده به خوبی در تشخیص الگوهای تنوع ژنتیکی به کار گرفته شده و می تواند برای مطالعات تشخیص ژرم پلاسم آینده در چاودار توصیه شود. مقدمه: جنس چاودار شامل نمایندگانی از فلور مدیترانه ای بوده و اعضاء این جنس به طور گسترده از اروپای مرکزی و غرب مدیترانه از بالکان، آناتولی، اسرائیل و قفقاز تا آسیای مرکزی توزیع شده اند. یک جمعیت ایزوله از این جنس نیز در آفریقای جنوبی وجود دارد. این جنس شامل گونه های چندساله با عمر کوتاه و طولانی، وحشی، چوبی و کشت شده می باشد (سنسر و هاکو، 1980). چاودار معمولی یکی از مهم ترین محصولات زراعی غلات بوده که در شرق و شمال اروپا کشت می شود. این گیاه دارای توانایی ارائه ی عملکرد بالا حتی هنگام رشد تحت شرایط تنش زای زیست محیطی مانند دماهای پایین، خشکی و باروری پایین خاک می باشد. وجود ژن های مقاوم به بیماری نیاز به محافظت شیمیایی گسترده از این محصول را کاهش می دهد (اسچلگل و ملز، 1996، کروزن و همکاران، 2001). علاوه بر این، چاودار دارای ترکیبات تغذیه ای مفید فراوانی مانند مجموعه کاملی از عناصر معدنی (روی، آهن، فسفر)، بتا گلوکان ها، نشاسته مقاوم و ترکیبات زیست فعال می باشد. محصولات چاودار دارای سطوح بالایی از فیبر رژیمی (اندرسون و همکاران، 2009) بوده که ممکن است به ارائه ی اثرات مثبت بر سلامت کمک کند (روسن و همکاران، 2011).

The primary aim of this study was to estimate genetic diversity among Secale cereale L. accessions using 22 previously published simple sequence repeat (SSR) markers. The plant material included 367 rye accessions comprising historical and contemporary cultivars, cultivated materials, landraces, and breeding strains from the Polish breeding company Danko. The studied accessions represented a wide geographical diversity. Several methods were employed to analyze genetic diversity among the Secale cereale L. accessions and to determine population structure: principal coordinate analysis (PCoA), neighbor-joining (NJ), and Bayesian clustering. We also defined a core collection of 25 rye accessions representing over 93 % of SSR alleles. The results of these analyses showed that accessions from the rye gene bank are clearly divergent in comparison with materials received directly from European breeding companies. Our findings suggest also that the genetic pool of current rye cultivars is becoming narrower during breeding processes. The selected panel of SSR markers performed well in detection of genetic diversity patterns and can be recommended for future germplasm characterization studies in rye. Introduction: The genus Secale comprises typical representatives of the Mediterranean flora, and its members are widely distributed from Central Europe and the Western Mediterranean through the Balkans, Anatolia, Israel, and the Caucasus to Central Asia. An isolated population also occurs in South Africa. The genus includes annuals, short-lived and long-lived perennials, wild, weedy, and cultivated taxa (Sencer and Hawkes 1980). Common rye (Secale cereale L.) is one of the most important cereal crops cultivated in Eastern and Northern Europe. It is characterized by the ability to produce high yields even when grown under environmental stress conditions, i.e., low temperatures, drought, and low soil fertility. The presence of disease resistance genes reduces the need for intensive chemical protection of this crop (Schlegel and Melz 1996; Korzun et al. 2001). Moreover, rye offers high contents of many nutritionally favorable compounds such as a whole suite of minerals (Zn, Fe, P), beta-glucans, resistant starch, and bioactive compounds. Rye products are characterized by a high level of dietary fiber (Andersson et al. 2009) that may contribute to positive health effects (Rosén et al. 2011).

بخشی از ترجمه مقاله (صفحه 13 فایل ورد ترجمه)